Sejak Honda menghidupkan kembali Prelude, para penggemar telah meminta gearbox manual. Namun, harapan yang tersisa untuk pedal ketiga sekarang telah sepenuhnya lenyap. Seorang pejabat senior perusahaan mengkonfirmasi pada Japan Mobility Show 2025 bahwa tidak ada rencana untuk manual, dengan alasan ketidakcocokan dengan powertrain hibrida. Meskipun kami sudah bisa menduga hal itu dari jauh, tetap saja menyedihkan untuk didengar. Berbicara dengan Australia's Drive Australia, Pimpinan Produk Besar Honda Horita Hidetomo menjelaskan bahwa perusahaan tidak dapat membuat manual bekerja dengan pengaturan hibrida Prelude. Meskipun secara teknis dapat dilakukan untuk CR-Z dan bahkan Insight, namun hal itu tidak lagi menjadi masalah mengingat tingkat elektrifikasi Prelude yang lebih tinggi. "Mesin [pada Insight dan CR-Z] adalah yang utama [alasan mengapa buku panduan tersedia], fungsi bantuan hibrida ada di sana. Sekarang listrik dan mesin sudah hampir setengah-setengah, itulah teknologi baru yang kami tawarkan saat ini. Honda tahu sejak awal bahwa menawarkan Prelude hanya dengan transmisi otomatis berisiko membuat "mengemudinya tidak terlalu menyenangkan," karena itulah mobil ini dirancang dengan mode berkendara S+ Shift. Paddle shift alloy di belakang setir memungkinkan pengemudi untuk melakukan perpindahan gigi yang disimulasikan, lengkap dengan putaran gigi yang disesuaikan dengan putaran mesin dan suara buatan melalui speaker untuk meniru pengalaman berkendara dengan transmisi manual. Fungsi S+ Shift tidak akan tetap eksklusif untuk Prelude, karena Honda berencana untuk menerapkan perubahan gigi buatan yang serupa pada mobil hibrida lainnya. Fitur ini mensimulasikan transmisi delapan percepatan, dan ketika fitur tersebut dimatikan, dayung dapat digunakan untuk menyesuaikan tingkat pengereman regeneratif. Keputusan untuk melewatkan gearbox manual melampaui keterbatasan mekanis. Hidetomo berpendapat bahwa sebagian besar pengemudi tidak ingin memindahkan gigi lagi: "[Ini otomatis karena] memenuhi kebutuhan masa kini." Meskipun hal itu mungkin benar, Prelude terasa seperti salah satu mobil yang seharusnya memiliki pedal kopling. Kemudian lagi, tidak jelas seberapa tinggi tingkat pengambilannya, sehingga sistem S+ Shift mungkin merupakan kompromi terbaik. Meskipun ada keraguan bahwa mobil ini tidak akan terjual, Prelude memiliki awal yang baik di Jepang. Honda telah menerima delapan kali lebih banyak pesanan daripada target penjualan bulanannya, menjelang peluncuran mobil ini di Amerika Serikat, Eropa, dan pasar lainnya. Untuk mempersingkat waktu tunggu, produksi sudah ditingkatkan. Waktu akan menunjukkan apakah momentum awal ini akan bertahan atau memudar seiring dengan meredanya antusiasme awal.